Na de dood van Habyarimana raasde een golf van geweld over Rwanda, waarbij meer dan 800.000 Tutsi’s en gematigde Hutu’s werden vermoord. Volgens de commissie werd het vliegtuig waarin Habyarimana, zelf Hutu, zich bevond, neergeschoten door afvallige soldaten uit zijn eigen leger. De commissie baseert haar bevindingen op analyse van ballistisch materiaal en de verklaringen van 557 getuigen.Habyarimana streefde voor zijn dood naar verzoening met Tutsi–rebellen en hun leider, de huidige president van Rwanda Paul Kagame. Radicale Hutu’s in de Rwandese regering wilden hier niets van weten en bereidden onder het oog van de VN een massaslachting voor. Na de aanslag op Habyarimana trokken Hutu–milities met kapmessen en andere wapens het land door om Tutsi’s te vermoorden.

De Franse onderzoeksrechter Jean–Louis Bruguière stelde eerder de Tutsi–rebellen van Kagame verantwoordelijk voor de aanslag. De diplomatieke betrekkingen tussen Frankrijk en Rwanda werden door de conclusies van Bruguière afgebroken. Frankrijk wil nu een nieuw onderzoek starten op basis van de resultaten van de Rwandese onderzoekscommissie.