Het plan omvat een compleet vernieuwde openbaarvervoerterminal, twee nieuwe woontorens van 140 en 100 meter hoog, enkele kantoortorens, een door Rem Koolhaas ontworpen gebouw op het stationsplein, ondergrondse parkeerplaatsen en in totaal vijfhonderd woningen.

„Dit project gaat het beeld en de skyline van de stad veranderen”, zei wethouder M. Norder. De stadsbestuurder verwijst daarmee onder meer naar de hoogbouw. Naast de twee woontorens die straks winkelcomplex Babylon overschaduwen, omvat het plan nog drie gebouwen van 70 meter. Het gaat dan om twee kantoorgebouwen boven het busplatform en om het ontwerp van Koolhaas, dat het huidige, door velen als zeer lelijk ervaren hoofdgebouw van het station aan het oog onttrekt.

De gemeente steekt 100 miljoen in Den Haag Nieuw Centraal. Het Rijk draagt 128 miljoen euro bij en het overige geld komt van private partijen, zoals IMCA Vastgoed, NS Vastgoed en Bouwfonds Property Finance. Het project krijgt in vijf fases gestalte. De voorbereiding van de werkzaamheden is al maanden geleden begonnen. De hal van het station moet in 2008 klaar zijn. Bezoekers komen dan terecht in een veel lichtere en prettiger toegankelijke ruimte. Dat is onder meer het resultaat van het nieuwe glazen dak, tien meter hoger dan het huidige, nauwelijks licht doorlatende exemplaar.

De ingebruikname van de woontorens en het gerenoveerde winkelcomplex Babylon staan vanaf 2008 gepland. De flat van Koolhaas op het plein aan de huidige voorkant van het station is in 2009 klaar. In de laatste paar jaar van het project worden de kantoren boven het busplatform geplaatst.

Het station is in 2011 een knooppunt waar reizigers voor hun vervoersmiddel kunnen kiezen uit onder meer hogesnelheidstreinen, Randstadrail, trams, gewone treinen en bussen. Wethouder B. Bruins (Verkeer) houdt rekening met jaarlijks 350.000 bezoekers in het station. Nu zijn dat er nog 190.000.