De zaak tegen Naturalis is aangespannen door architect Fons Verheijen. Hij ontwierp het gebouw dat in 1998 werd opgeleverd. Volgens hem is er sprake van verminking van zijn ontwerp en hij meent dat met de verbouwing inbreuk wordt gemaakt op zijn auteursrecht.

Directeur Edwin van Huis is teleurgesteld over de beslissing. Volgens hem heeft het museum eigenlijk geen keuze, omdat het aantal bezoekers fors is gegroeid én de collectie en het aantal onderzoekers is toegenomen. „We bestuderen de uitspraak nader en beraden ons op een hoger beroep. Deze uitspraak van vandaag heeft grote gevolgen voor zowel het museum als de onderzoekswerkzaamheden, de stad en met name onze bezoekers.”