In 2009 wilde Emergis fuseren met het Brabantse GGZ WNB, dit jaar met de Parnassia Bavo Groep uit Zuid-Holland. Beide keren ging de fusie niet door. In het geval van de Parnassia Bavo Groep wordt nog onderzocht of er meer samengewerkt kan worden.

Tijdens de maandenlange voorbereidingen voor de fusies werd voor ongeveer 1 miljoen euro aan kosten gemaakt. Dat is „geen weggegooid geld”, zegt Leen van Leersum, voorzitter van de raad van bestuur van Emergis. Volgens hem heeft het fusieproces „ook inzicht in de eigen organisatie opgeleverd.”