Tegelijkertijd heeft de Raad van State in een andere uitspraak bepaald dat het college van Gedeputeerde Staten van Noord–Holland een nieuw besluit moet nemen over de baggerstort in de voormalige zandwinput in het Gooimeer bij Naarden.De Raad van State vindt dat het provinciebestuur bij de vergunning voor de baggerstort in het Gooimeer bij Naarden onderzoek had moeten doen naar de gevolgen voor het natuurgebied, die deze baggerstort in combinatie met de stort op een andere locatie zou kunnen veroorzaken. De baggerstort bij Huizen mag wel doorgaan omdat er op dat moment nog geen andere vergunningen voor het storten van bagger waren verleend.

Het Antislib Platform Gooimeer (APG) had tegen beide vergunningen voor het storten van bagger bezwaar gemaakt. Het APG vreesde verder dat de baggerspecie gevaarlijke stoffen zou bevatten die schadelijk zijn voor de visstand in het natuurgebied ’Eemmeer, Gooimeer en IJmeer’.