Een dag in de week werkt Osterhaus bij ViroClinics in Rotterdam, een bedrijf van het Erasmus MC dat onderzoek doet naar medicijnen tegen virussen en de werkzaamheden van vaccins. Dit gebeurt in opdracht van de overheid en de farmaceutische industrie. De onderneming ontwikkelt en produceert geen vaccins. In het geval van de Mexicaanse griep heeft het bedrijf onderzoek verricht voor alle farmaceutische bedrijven die om een advies hadden gevraagd.Osterhaus bezit certificaten die recht geven op 9,9 procent van de aandelen van ViroClinics. De aandelen zijn ondergebracht in een stichting. Het stichtingbestuur heeft de zeggenschap over de aandelen. Verder heeft Osterhaus geen inspraak op het financiële beleid van de onderneming.

Hij doet niets geheims en niets dat niet mag, zo maakt de viroloog duidelijk. Al het geld dat het bedrijf met de samenwerking met de farmaceutische industrie verdient, komt volgens hem ten goede aan wetenschappelijk onderzoek. Volgens het Erasmus MC handelt Osterhaus volledig integer. „De wetenschappelijke integriteit staat al vele jaren op bijzondere hoogte. De manier waarop hij met belangen omgaat zijn volledig transparant, vooraf bekend en volledig conform afspraken en regels".

De gezondheidsraad adviseerde minister Ab Klink (Volksgezondheid) vaccins tegen de Mexicaanse griep in te slaan. In een brief aan de Tweede Kamer schrijft Klink dat Osterhaus geen lid is van de commissie van de Gezondheidsraad die dit advies heeft opgesteld, maar slechts adviseur. Op deze manier kan de expertise van onderzoekers die banden hebben met het bedrijfsleven toch bij een advies betrokken worden. Osterhaus heeft tegenover de Gezondheidsraad altijd aangegeven betrokken te zijn bij ViroClinics. Het gaat om informatie die lang en breed bekend was, schrijft Klink.