Het Hof vindt het strijdig met EU-regels dat de overheid wel een vergunning eist voor het uitzaaien van buitenlandse mosselen en oesters, maar niet van Nederlandse.Nederland had de vergunningplicht ingesteld om de inheemse natuur van de Waddenzee te beschermen tegen ziektes en andere bedreigingen uit andere zeegebieden. Maar het Hof vindt de hele zee van het Kanaal tot de Duitse Waddenkust een enkel gebied. De rechters menen ook dat er al ruim dertig jaar Ierse mosselen in de Oosterschelde worden uitgezaaid zonder schade voor de natuur.

Het ministerie van LNV is niet ongelukkig met de uitspraak. Nederlandse vissers, die het zaad uit het buitenland laten komen, hebben tot dusver twee vergunningen nodig. Daarvan vervalt er door de uitspraak één, de vergunning die nodig is op grond van de visserijwet. Wel hebben de vissers nog steeds een vergunning nodig op grond van de natuurbeschermingswet. Volgens een woordvoerster van LNV gaat het in feite om een „vereenvoudiging" in de regelgeving.