Met de koppeling van beide diensten is het grootste openbaar vervoernetwerk over water in Nederland ontstaan. De waterbus en de fast ferry gingen in 2000 varen. In het eerste jaar stapten 1,2 miljoen mensen aan boord. Voor dit jaar verwacht het bedrijf 2,25 miljoen passagiers, 400.000 meer dan in 2005.Volgens een woordvoerder van Waterbus is de OV-voorziening niet alleen gewild bij forenzen, maar ook bij dagjesmensen en toeristen. Rotterdammers reizen over het water naar de molens van Kinderdijk of de historische Dordtse binnenstad, inwoners van de Drechtsteden bezoeken Rotterdamse evenementen of gaan er winkelen. De fiets mag mee aan boord.

De waterbus vaart drie routes. Route 1 vaart tussen Dordrecht en Rotterdam met om het half uur een afvaart. De reistijd is een uur. Route 2 verbindt de Drechtsteden. Elke 15 minuten is er een afvaart. Op deze schepen is plaats voor 130 passagiers en zestig fietsen. Route 3 vaart tussen Ridderkerk, Krimpen a/d Lek en Kinderdijk. Elk half uur is er een afvaart. Dit schip heeft plaats voor honderd passagiers en veertig fietsen. Vanaf het centrale knooppunt aan de Dordtse Merwekade doen de catamarans van de Waterbus ook de Hollandse Biesbosch aan.