Het onderzoek, dat door kenniscentrum COAP wordt uitgevoerd, is een verdieping op het onderzoeksrapport van de Commissie-Van Rijn over grensoverschrijdend gedrag binnen de publieke omroep. Het onderzoek van de NTR bestaat uit een evaluatie van het proces van de herinrichting van de omroep uit 2019-2020 en naar de huidige cultuur bij de NTR. Francissen was in die periode direct verantwoordelijk bij de omroep en legt daarom gedurende het onderzoek tijdelijk haar taken neer. Haar werk wordt waargenomen door zakelijk directeur Lucas Goes.

De NTR benadrukt dat de tijdelijke terugtreding van Francissen niet bedoeld is als voorschot op de uitkomsten van het onderzoek. „Het houdt enkel en alleen verband met de voortgang van het onderzoek en niet met de persoon Willemijn, in wie wij zowel persoonlijk als professioneel alle vertrouwen hebben.” Tot het onderzoek is afgerond, zal de omroep geen verdere mededelingen doen.