Zo daalde het aantal mensen die bereikt werden met hiv-preventie en -behandeling met 11 procent ten opzichte van 2019, terwijl het testen op hiv met 22 procent afnam. In de landen waarin het fonds investeert werden in 2020 ongeveer 4,7 miljoen mensen behandeld voor tuberculose, ongeveer een miljoen minder dan in 2019.

Daarentegen lijkt de bestrijding van malaria minder zwaar getroffen te zijn dan hiv en tbc door de aandachtsverschuiving die Covid-19 heeft meegebracht. Het aantal gedistribueerde muskietennetten steeg zelfs met 17 procent, tot 188 miljoen. Ook het aantal met tegen malaria beschermende spray behandelde huizen en gebouwen nam toe, hoewel slechts met 3 procent.

In 2020 heeft het Global Fund 3,55 miljard euro (4,2 miljard dollar) geïnvesteerd in de bestrijding van hiv, tbc en malaria. Tevens keurde het 827,4 miljoen euro aan financiering goed voor de reactie op Covid-19.