De afscheidingsbeweging gebruikt in de regel ontstekingsmechanismen van aluminium. Het radiostation citeerde veiligheidsfrunctionarissen die meldden dat de rugzakbommen met mobieltjes waren geactiveerd. De wekker was op alle telefoontjes op 7.39 uur gezet. Het Spaanse ministerie van Binnenlandse Zaken kon het bericht niet bevestigen.

Het onderzoek naar de daders richt zich onder meer op een niet-ontplofte bom. De Spaanse politie hoopt volgens de krant El Mundo dat een onschadelijk gemaakte rugzakbom sporen toont die leiden naar de plegers van de bomaanslagen. Deze bom werd gevonden op het station van El Pozo del Tio Raimundo, een buitenwijk van Madrid, waar donderdag ook bommen in een forenzentrein ontploften.

Vooral het ontstekingsmechanisme dat verbonden was met de springstoffen kan waardevolle informatie geven over de herkomst en over de daders. Het zou een groot probleem bij het onderzoek zijn geweest indien alle bommen waren geëxplodeerd. Tien ontploften in treinen en die richtten de enorme slachting aan. Maar drie andere werden tijdig ontdekt.

De mijnopruimingsdienst heeft er twee onschadelijk moeten maken door ze te laten exploderen. De dertiende kon vrijdagmorgen vroeg op het politiebureau van het district Vallecas onschadelijk worden gemaakt zonder explosie. Hierdoor is een analyse van de bom mogelijk.

Verder worden vanzelfsprekend de opnames van bewakingscamera’s op de stations doorgelicht. Met name de beelden gemaakt op het station Alcala de Henares zouden informatie over daders kunnen bieden. Op dat station zouden daders de rugzakbommen hebben geplaatst in treinen die richting Madrid-Atocha reden. Bij het station is een gestolen auto gevonden met ontstekingsmechanismen en een cassettebandje met koranteksten.

Het is niet duidelijk of het onderzoek al een duidelijk spoor heeft opgeleverd. Minister van Binnenlandse Zaken Acebes heeft vooralsnog vooral vragen opgeroepen. Hij zei aanvankelijk dat het zeker was dat de ETA achter de aanslag zat, maar krabbelde later terug. Er waren ook tegenstrijdige berichten over de springstoffen. Het zou eerst gaan om enkel dynamiet en vervolgens ook om een stof van een soort dat ETA-terroristen eerder in Frankrijk stalen.