Eigenaar Arla Foods besloot het merk te herintroduceren. Alle dagverse producten die Arla voorheen onder het merk Friesche Vlag verkocht, dragen nu de naam Melkunie.

In 2001 haalde toenmalig eigenaar Campina het merk van de markt. Toen Campina in 2009 met Friesland Foods fuseerde, moest de nieuwe organisatie van de EU de merknamen Melkunie en Friesche Vlag (voor dagverse zuivel) van de hand doen. Arla werd de nieuwe eigenaar.

Onderzoek wijst uit dat de helft van de Nederlanders denkt dat Melkunie nooit weg is geweest.