De aanklachten over beweerd wanbeleid en corruptie in de jaren van Portillos presidentschap (2000 - 2004) waren behalve door het Openbaar Ministerie ook naar voren gebracht door de Internationale Commissie tegen de Straffeloosheid in Guatemala (Cicig). Portillo was het eerste Guatemalteekse staatshoofd dat zich voor corruptie in zijn regeerperiode voor de rechter moest verantwoorden.

Het Amerikaanse ministerie van Justitie heeft nog een uitleveringsverzoek tegen Portillo lopen. Portillo is volgens Amerikaanse aanklagers in New York verantwoordelijk geweest voor het witwassen van drugsgeld.