De bodyscanners zijn omstreden omdat ze door de kleding heen kunnen kijken: monitorbeelden tonen een soort blootfoto’s, zo bekritiseren tegenstanders die een beroep doen op privacyregels. Nederland en enkele andere EU–landen zijn groot voorstander, maar Spanje is huiverig. Schiphol bestelde al zo’n zestig scanners.„Ik ben voor EU–brede regels over invoering", zei de Estse kandidaat–commissaris. „Bodyscanners kunnen de veiligheid in de strijd tegen terrorisme verbeteren".

CDA–Europarlementslid Corien Wortmann is voor invoering van de scanners op risicovluchten. „Ze zijn niet de oplossing voor alle problemen, maar zeker een onderdeel van de veiligheid.".