„Maar eerst de crisis bestrijden. Laten we dit traject niet belasten met een onderzoek”, hield de minister de Kamer voor. „Die evaluatie begint zodra de crisis onder controle is. Maar eerst hier goed doorkomen”. Waalkens wilde aanvankelijk dat een onafhankelijke commissie op 1 februari aan de slag zou gaan om voor de zomer te rapporteren. Omdat CDA, ChristenUnie en SGP wel onderzoek willen, maar pas als de rust rond de ziekte weer een beetje is weergekeerd, liet de PvdA’er die nabije datum los.Waalkens vraagt nadrukkelijk om meer dan een gewone evaluatie. Hij wil aandacht voor de in zijn ogen belabberde communicatie tussen de ministeries van Volksgezondheid en Landbouw en de manier waarop die departementen vervolgens de Voedsel en Waren Autoriteit (VWA) aanstuurden. „Ook alle momenten van besluitvorming en momenten van nieuwe ontwikkelingen waarbij geen besluitvorming volgde vanaf 2007 ”, wil hij op een rijtje hebben. De PvdA’er vindt een volstrekt onafhankelijk onderzoek nodig om een gewogen politiek oordeel te kunnen maken. Hij kreeg bijval van SP , GroenLinks en D66. Volgens Verburg worden die zaken meegenomen in de evaluatie.

Het CDA, ChristenUnie en SGP willen wel onderzoek. Maar zij stellen: „Tijdens een brand moet je de brand blussen en niet gaan evalueren. Er zijn natuurlijk lessen te leren, maar het gaat er nu om de Q–koorts te minimaliseren”, stelde Henk Jan Ormel (CDA). De ChristenUnie sloot zich daarbij aan. De kleinste coalitiepartij vindt dat terugblikkend op de ontwikkelingen rond de Q–koorts het beeld opdoemt van een traag handelende overheid. Hadden we eerder krachtig kunnen ingrijpen, vraagt Cramer (CU) zich af.