Hij wil dat pas doen als het kabinet de maandelijkse korting opheft van bijna 1000 euro op het salaris van europarlementariërs.Manders is bereid de code te onderschrijven en af te zien van de vrijwillige aanvullende pensioenregeling die het Europees Parlement kent, maar dan moet het kabinet de korting van bijna 1000 euro opheffen.

De code werd in 2004 afgesproken en door alle Nederlandse europarlementariërs ondertekend, op Manders en zijn VVD-collega Mulder na.

Volgens Manders is de korting in strijd met het Europees Verdrag. Hij ging daarover in gesprek met partijgenoot en minister van Binnenlandse Zaken Remkes, maar kreeg nul op het rekest. Volgens bronnen in Brussel had Manders de steun van de ministers Brinkhorst, Bot en Peijs, allen met ervaring in Brussel. Maar de angst voor de publieke opinie zou te groot zijn geweest om Manders gelijk te geven.

Volgens Manders is de gedragscode hypocriet en is de korting te danken aan „afgunst bij Tweede Kamerleden”, die besloten om de korting in te stellen. Aanleiding voor de code was het vermoeden dat europarlementariërs veel geld overhielden van hun reis- en onkostenvergoeding, maar volgens Manders is dat onzin. Hij zegt dat dat is aangetoond in onderzoek door oud-president Koning van de Algemene Rekenkamer.

Zijn collega en partijgenoot Jan Mulder houdt zich aan de gedragscode, maar heeft vanuit principieel verzet ook geweigerd de code te ondertekenen.

Nederland is het enige land binnen de EU dat een korting heft op het salaris van de europarlementariërs. In 2009 is het hele probleem opgelost. Dan worden de europarlementariërs niet meer net zo betaald als hun nationale collega’s, maar krijgen ze uit het budget van de Europese Unie allemaal hetzelfde salaris, rond de 7000 euro bruto per maand.