Vijf Marokkanen zijn aangeklaagd wegens de moord op 191 mensen en 1755 pogingen tot moord. Ook de andere gedaagden zijn hoofdzakelijk van Marokkaanse komaf. Vijf Spanjaarden moeten zich verantwoorden voor het leveren van de explosieven aan de terroristische cel.Het onderzoeksrapport over de aanslagen telt 1471 pagina’s. Een van de bevindingen is dat niet het terroristennetwerk Al Qaida achter de aanslagen zat, maar een islamitische cel „geïnspireerd" door de terreurbeweging. Een artikel op het internet gaf de daders het idee om vlak voor de Spaanse parlementsverkiezingen een aanslag te plegen, zodat Madrid zijn militairen uit Irak zou terugtrekken. De terroristen hadden volgens het rapport zeker geen betrekkingen met de Baskische afscheidingsbeweging ETA.

De rechtszaak tegen de terreurverdachten begint volgend jaar. De behandeling zal naar verwachting een jaar duren. Onder de Spaanse wet kunnen de terroristen maximaal veertig jaar gevangenisstraf krijgen.