De 51-jarige Endstra werd op 17 mei 2004 doodgeschoten bij zijn kantoor aan de Apollolaan in Amsterdam-Zuid. Een naast hem lopende zakenrelatie raakte gewond. Endstra had destijds contacten met tal van criminele kopstukken in Amsterdam; zij brachten hun misdaadfortuin bij hem onder om het op die manier wit te wassen.

De zaak tegen de drie verdachten - Ziya G. (49), Ali N. (38) en Özgür C. (43) - sleept al jaren. Na strafeisen tot zestien jaar cel sprak de rechtbank het trio in 2016 vrij. De drie zijn volgens het Openbaar Ministerie, dat tegen de vrijspraken in beroep ging, betrokken geweest bij de voorbereiding van de moord. De schutter zou de Rus Namik Abbasov zijn geweest. Hij bezweek in 2012 in zijn cel aan een hersenbloeding.

De drie mannen zouden hebben behoord tot de ‘Groep Alkmaar’, een moordcommando dat opdrachten zou hebben uitgevoerd voor Willem Holleeder en zijn criminele handlangers. Holleeder is in 2019 in hoger beroep veroordeeld tot levenslang voor het verordonneren van een reeks onderwereldmoorden, waaronder die op Endstra. In een eerder proces werd hij veroordeeld voor het afpersen van onder anderen Endstra.