Volgens Bosnische media wordt hij ervan beschuldigd in 1993 te hebben deelgenomen aan de ontvoering van vijf burgers, die vervolgens werden opgesloten en gemarteld in een kamp in het Centraal–Bosnische Travnik. Een van de ontvoerden, een Serviër, werd onthoofd.

Maktouf zou een internationaal bekende crimineel zijn en contacten hebben gehad met het voormalige Taliban–regime in Afghanistan. Hij werd op 11 juni uitgeleverd aan Sarajevo nadat hij was opgepakt in Canada. Het proces vindt, met instemming van het Joegoslavië–Tribunaal in Den Haag, plaats in Bosnië.

Tijdens de oorlog zijn honderden moslims uit met name de Arabische wereld naar Bosnië–Herzegovina getrokken om tegen de Serviërs te strijden. Vele tientallen van hen zijn na de oorlog gebleven en hebben de Bosnische nationaliteit gekregen als oud–strijder of door een huwelijk met een Bosnische vrouw.