In eerste instantie wilde de bewindsvrouw het onderzoek in eigen hand houden. Zondag kondigde ze op de televisie aan dat er twee onderzoeken komen. Een extern bureau moet onderzoek uitvoeren naar benoemingen in de ambtenarenschalen 16 en hoger, naar vergoedingen voor reis- en representatiekosten en naar de toeslagen op de salarissen. De Algemene Rekenkamer voert onderzoek uit naar de rechtmatigheid van toelagen en het financiële beheer op het departement.

Van der Hoeven riep de ambtenaren die de zelfverrijking in een anonieme brief hebben gemeld, op om zichzelf bekend te maken en hun beschuldigingen met feiten te staven. De ambtenaren krijgen dan de bescherming die een klokkenluider toekomt. Als de beschuldiging niet waar is, krijgen ze dan geen ontslag.

Het aantal vertrouwenpersonen op het departement waar ambtenaren misstanden kunnen melden, zal toenemen van een naar drie.