Tegen Rais was tien jaar geëist. De rechtbank vond Rais schuldig aan het vervalsen van zijn eigen identificatiedocumenten en aan het vervoeren van de explosieven die later zijn gebruikt.

Rais heeft altijd ontkend dat hij wist wat er ging gebeuren. Wel gaf hij toe lid te zijn van de terreurgroep Jemaah Islamiyah. Hij is een van de twintig verdachten die in de zaak zijn gearresteerd. Bij de aanslag op 5 augustus 2003 kwamen twaalf mensen om, onder wie een Nederlandse bankier.