Cunha moet nu terechtstaan voor zijn rol in de aanschaf van twee boorschepen door staatsoliebedrijf Petrobras, waarmee smeergeld gemoeid zou zijn geweest. Eerder verzocht justitie al zijn aftreden als voorzitter van het lagerhuis omdat hij het gerechtelijk onderzoek naar corruptie bij Petrobras zou hebben belemmerd.

De ethische commissie van het parlement onderzoekt bovendien of Cunha heeft gelogen over geheime Zwitserse bankrekeningen. De uitkomst van dat onderzoek kan hem zijn parlementszetel kosten.