Zvedan Jovanovic, een agent van de inmiddels ontbonden speciale politie–eenheid JSO, had de moord in eerste instantie bekend tijdens de politieverhoren. Die bekentenis heeft hij later weer ingetrokken.

Milan Veruovic, een lijfwacht van Djindjic die bij de aanslag zwaargewond raakte, betwist de officiële lezing van slechts een schutter. Volgens hem hebben twee mannen uit verschillende richtingen op de premier geschoten.

Naast het aantal daders blijft ook onduidelijk wie achter de moord zat en wat de motieven waren. Opdrachtgever zou Milorad Lukovic bijgenaamd Legija kunnen zijn, die onder president Milosevic leiding gaf aan een speciale politie–eenheid. Lukovic is voortvluchtig.