Mowat schreef meer dan 40 boeken, waarvan zo’n 17 miljoen exemplaren zijn verkocht. Een belangrijk thema in zijn werk waren het koude, dunbevolkte noorden van Canada, zijn natuur en zijn mensen. Hij werd in 1952 bekend met zijn eerste boek, People of the Deer, over de noden van een Inuit-stam en de onverschilligheid van de Canadese regering jegens de eskimo’s.

Het onder Nederlandse vlag varende schip Farley Mowat was jarenlang het vlaggenschip van de natuurbeschermingsorganisatie Sea Shepherd, die zich onder meer inzet voor walvissen.