Indonesië is het land met de grootste moslimbevolking. Ongeveer 90 procent van de bevolking beschouwt zichzelf als moslim. Sinds 2002 worden minderheden als christenen, sjiitische moslims en aanhangers van Ahmadiyah, een islamitische sekte, steeds vaker aangevallen door radicale soennitische moslims die banden hebben met al-Qaeda.

Volgens de mensenrechtenorganisatie Human Rights Watch waren er in 2012 zeker 260 incidenten in Indonesië waarbij religieuze minderheden werden aangevallen. De organisatie zegt dat sommige kabinetsleden dit geweld aanmoedigen.