Hij wordt beschuldigd van verraad tijdens zijn bewind van 1999 tot 2008. Hij riep toen de noodtoestand uit en ontsloeg belangrijke rechters. Musharraf was in de rechtszaal toen het arrestatiebevel werd uitgevaardigd, maar hij werd niet gearresteerd. Hij vertrok met zijn lijfwachten naar een landgoed, dat werd omsingeld door de politie.

Er hangen hem meerdere rechtszaken boven het hoofd, onder meer omdat hij zijn politieke rivaal en oud-premier Benazir Bhutto niet afdoende zou hebben beveiligd. Zij kwam in 2007 om het leven door een aanslag. Musharraf werd door de Taliban met de dood bedreigd wegens zijn steun aan Washington in de strijd tegen het terrorisme.

Waarnemers menen dat het onwaarschijnlijk is dat de ex-generaal, die in 1999 na een legercoup aan de macht kwam, wordt gearresteerd. Ze denken dat het nog steeds machtige leger een dergelijke vernedering voor een voormalige generaal niet accepteert.

Het arrestatiebevel laat zien hoe geïsoleerd de ex-president is komen te staan, nadat hij in 2008 was afgetreden. Dat bleek destijds ook al toen de belangrijkste oppositiepartij, de Pakistaanse Volkspartij (PPP) van de vermoorde ex-premier Benazir Bhutto van plan was een afzettingsprocedure tegen hem te beginnen wegens wanbeleid.

Musharraf bereikte als president in 2003 met de politieke partijen een overeenkomst. Volgens dit akkoord mocht Musharraf tot 2007 president blijven. Dit legde de basis voor het conflict met rechters in 2008 toen het hooggerechtshof weigerde zijn herverkiezing als president goed te keuren. Musharraf stelde daarop de noodtoestand in en verving onwillige rechters voor goedgezinde magistraten.

Musharraf werd in augustus 1943 geboren in Delhi in India, vier jaar voor de onafhankelijkheid van Brits-India. In 1947 trok zijn familie met miljoenen andere moslimgezinnen naar de nieuwe islamitische staat Pakistan. In 1964 begon hij zijn militaire carrière. In 1998 werd hij stafchef van het Pakistaanse leger.