Via de website van de kerk kunnen mensen stemmen op hun favoriete kerktoren. Ook kerktorens die momenteel geen dienst meer doen voor kerkelijke activiteiten kunnen meedoen. Presentator Hans van Willigenburg bespreekt via uitzendingen op radio en tv de reacties en beklimt zelf de mooiste kerktorens.

De kerk wil met de verkiezing de waarde van kerken en hun torens voor het voetlicht halen. Torens hebben niet alleen een historische maar ook een maatschappelijke waarde. De tijd was in de middeleeuwen door het gelui van de kerkklokken beter gelijk te zetten in Nederland. Kerktorens waren ook wachttorens om vriend of vijand te zien naderen. Emotioneel gezien staat de kerktoren nog steeds in het midden van dorp of stadshart. „Nederland mag dan behoorlijk ontkerkelijkt zijn, kom niet aan haar kerktorens! Kerktorens zijn belangrijke merktekens in het landschap. Ze roepen bij de bevolking van een regio een gevoel van nostalgie op. Als mensen terugkeren van vakantie en hun kerktoren weer in zicht krijgen, geeft dat hun een gevoel van thuiskomen.”

In 2009 schreef de NCRV een kerkenverkiezing uit. Toen werd de Heilige Willibrordusbasiliek in Hulst (Zeeuws-Vlaanderen) verkozen tot mooiste kerk van Nederland.