Sinds het rapport Bestuurlijke praktijken van november 2008 zijn er drie zeer zwakke basisscholen bijgekomen en heeft één zeer zwakke school zich verbeterd. Het aantal zwakke islamitische basisscholen is afgenomen van veertien naar twaalf.In november 2008 werd bekend dat het ministerie 2,5 miljoen euro terugvorderde aan door scholen onrechtmatig verkregen of bestede bekostiging. „Daar komt nu een bedrag van 1,6 miljoen euro bij, nu een accountant er nog eens naar heeft gekeken. Eerder maakte OCW al bekend meer dan 2 miljoen euro terug te vorderen. De totale voorgenomen terugvordering komt hiermee op 6,1 miljoen euro", aldus het ministerie dinsdag.

Het gaat om geld dat in de periode 2004–2005 niet goed is besteed aan leerlingenvervoer en personeelskosten. Ook de veelbesproken Amsterdamse basisschool As Siddieq krijgt een terugvordering aan de broek. Die heeft niets te maken met de opschorting van subsidie van vorige week in verband met de problemen met de burgerschapsvorming op de school.