De bewindsvrouw sprak ook steun uit voor de regering in Somalië, die enkele maanden geleden aantrad en die slechts een geringe machtbasis heeft. Islamitische extremisten en criminele bendes vormen een grote bedreiging voor de regering van president Sheikh Sharif Ahmed. Zij controleren grote delen van het land, dat al bijna twintig jaar in de greep is van oorlogsgeweld.De minister uitte de vrees dat Somalië een toevluchtshaven wordt voor terroristen, vergelijkbaar met het grensgebied van Pakistan en Afghanistan. „Dat zou een bedreiging voor de Verenigde Staten zijn”, aldus Clinton.

Het buurland Eritrea speelt volgens Clinton een kwalijke rol in het conflict. De Eritrese regering moet volgens de minister stoppen met het steunen van de islamisten in Somalië. De acties van Eritrea zijn volgens Clinton onacceptabel. „Wij zullen actie ondernemen als ze er niet mee stoppen”, aldus een dreigende Clinton.

Amerikaanse regeringsfunctionarissen repten eerder van mogelijke sancties tegen Eritrea. Verschillende volksvertegenwoordigers hebben al voorgesteld Eritrea te plaatsen op de lijst van landen die het terrorisme steunen.

De Somalische president Sharif zei op de persconferentie met Clinton dat de Amerikanen Somalië beloften hebben gedaan op het gebied van onder meer veiligheid en humanitaire zaken. Hij zei dat Somalië samenwerking met landen als de VS nodig heeft om uit de huidige moeilijke situatie te komen.

Clinton is bezig aan een reis van een anderhalve week door Afrika. Naast Kenia bezoekt ze onder meer Zuid–Afrika, Nigeria en de Democratische Republiek Congo.