Als zij meedoen met een alternatieve registratie, kunnen zij alsnog voldoen aan de regels. Dat heeft het ministerie van Landbouw de gewetensbezwaarden laten weten in een brief. Met de brief zijn een kleine zestig veehouders erkend als gewetensbezwaarden. Zij moeten voor 15 december laten weten of zij wel willen meedoen met de alternatieve registratie. De uitzondering wordt alleen voor deze groep gemaakt, die bestaat uit zowel professionele als hobbyboeren.

De gewetensbezwaarden moeten foto’s maken van hun runderen met zichtbaar daarop het oormerk en die opsturen naar het bureau dat de registratie bijhoudt. Ook moeten ze een haarmonster nemen. Dieren die van de boerderij af gaan, moeten alsnog een flap krijgen.

De oormerken werden in 1991 verplicht, onder andere om dierziektes snel te kunnen opsporen.