De 65-jarige Zuma trad in zijn geboortestreek KwaZulu-Natal in het huwelijk met de 33-jarige Nompumelelo Ntuli, bij wie hij twee kinderen heeft. Hoewel in de Zoeloegemeenschap polygamie geen uitzondering vormt, stuit de traditie op veel weerstand bij moderne Zuid-Afrikanen.Zuma houdt zijn privéleven zo veel mogelijk geheim. Hij zou meer dan tien kinderen hebben en ten minste één andere echtgenote. Eerder scheidde hij van de Zuid-Afrikaanse minister van Buitenlandse Zaken, Nkosazana Dlamini Zuma. Een andere echtgenote pleegde acht jaar geleden zelfmoord.

Zijn huwelijkse leven is echter bij lange na niet de enige controverse rond de kersverse ANC-leider en gedoodverfde opvolger van president Thabo Mbeki. In 2005 ontsloeg Mbeki Zuma als vicepresident, nadat zijn financiële adviseur was veroordeeld omdat hij had geprobeerd smeergeld binnen te halen voor Zuma. Volgend jaar staat Zuma terecht voor aanklachten van corruptie, afpersing en witwassen, terwijl hij vorig jaar nog werd vervolgd wegens verkrachting. Van die aanklacht werd hij vrijgesproken.