Rechter Pedro Guillermo Urbina bepaalde dat Fujimori zich schuldig had gemaakt aan machtsmisbruik toen hij in november 2000 een militaire adviseur opdracht had gegeven zich voor te doen als openbaar aanklager en zonder huiszoekingsbewijs het luxe appartement van de vrouw van de chef van de geheime dienst, Vladimiro Montesinos, te doorzoeken. De oud-president wordt in meerdere rechtszaken berecht voor in totaal zeven aanklachten wegens mensenrechtenschendingen en corruptie.Bij de opening van een ander proces schreeuwde een woedende Fujimori maandag dat hij niet schuldig was aan de aanklacht dat een militair doodseskader in zijn opdracht in het begin van de jaren ’90 veronderstelde leden en collaborateurs van de maoïstische guerrillabeweging Lichtend Pad uit de weg had geruimd. Als hij schuldig wordt bevonden, kan de oud-president dertig jaar gevangenisstraf en een boete van 22,5 miljoen euro krijgen.

Fujimori werd in 1990 als politiek outsider tot president gekozen. Zijn harde optreden tegen de guerrillabeweging en zijn economische hervormingen leverden hem aanvankelijk enorme populariteit op, maar zijn regering werd steeds autoritairder, waarbij intimidatie van nieuwsmedia, mensenrechtengroepen en politieke partijen niet werd geschuwd. Toen in 2000 een corruptieschandaal rond zijn naaste medewerker Montesinos aan het licht kwam, vluchtte hij naar Japan, het geboorteland van zijn ouders.

In 2005 verhuisde hij naar Chili, in de verwachting op een lichte aanklacht te worden uitgeleverd aan Peru en in de hoop daar weer een politieke rol te kunnen vervullen. Maar hij had er kennelijk geen rekening mee gehouden dat het Chileense hooggerechtshof ook zijn uitlevering zou goedkeuren op de aanklachten wegens mensenrechtenschendingen.