Een onafhankelijk onderzoeksteam van de WHO heeft twee weken lang onderzoek verricht naar de aanpak van het aidsvirus in verschillende Indonesische provincies. Het team kwam tot de ontdekking dat de Indonesische regering weliswaar op een goede manier met de epidemie omgaat, maar dat er meer op lokaal niveau gedaan moet worden.Zo is het belangrijk dat op de lange termijn geld beschikbaar blijft voor de bestrijding van het virus en moet de toegang tot condooms, aidstests en artsen verbeterd worden. Ook benadrukte de WHO de noodzaak van de bestrijding van seksueel overdraagbare aandoeningen.

Volgens het rapport van de WHO waren er in 2006 2873 nieuwe gevallen van aids in Indonesië, een toename van 140 procent ten opzichte van 2004. Papoea, de meest afgelegen provincie van Indonesië, kent het grootste aantal dragers van het aidsvirus. Het gemiddelde ligt hier twintig keer hoger dan in de rest van Indonesië. Van de bevolking in de provincie is 2 procent besmet met het virus.

De WHO waarschuwde Indonesië, met zijn 220 miljoen inwoners, eind 2006 al voor het uit de hand lopen van de aidsepidemie. In tegenstelling tot omringende landen als Thailand en Cambodja heeft Indonesië zijn aidsepidemie nog steeds niet onder controle. In totaal zijn tussen de 169.000 en de 216.000 Indonesiërs besmet met het aidsvirus.