Het gebouw is ontworpen door architectenbureau Roos en Ros uit Oud-Beijerland. Hoofdaannemer was De Vries en Verburg uit Stolwijk. De bouw duurde een klein jaar. De voorgevel heeft een massieve uitstraling doordat de voegen onzichtbaar zijn. Het gebouw herbergt 711 leerlingen. Dat aantal kan uitgroeien tot 830.De locatie Marnix zat tot op heden verspreid over drie locaties. Behalve in de hoofdvestiging op de Montessorilaan werd er lesgegeven in een voormalig internaat, en door de fusie met het praktijkonderwijs was er sinds enkele jaren ook een locatie in Barendrecht.

In februari 2001 werd bekend dat de school in Dordrecht mocht verhuizen naar een voormalige mts aan de Waterinklaan, waar op dat moment het Da Vincicollege zat. Dat gebouw werd echter niet in gebruik genomen, omdat er veel aanpassingen nodig waren.

Locatie Marnix is de voormalige Balthasar Lydiusmavo, die in 1993 met de vbo-afdeling van de Planciusscholengemeenschap in Rotterdam opging in scholengemeenschap De Swaef. In 1995 verenigde De Swaef zich met de Rotterdamse scholengemeenschappen Guido de Brès en Jacobus Revius, waardoor het Wartburg College ontstond. De locatie De Swaef Dordrecht heet sinds 1997 locatie Marnix. Aanvankelijk was L. Stolk locatiedirecteur. Hij werd in 2001 opgevolgd door drs. D. van Meeuwen.

Volgende maand kan het Wartburg College opnieuw een nieuwe accommodatie officieel in gebruik nemen: die van locatie Guido de Brès in Rotterdam-Zuid, waar 1600 leerlingen onderwijs ontvangen.