De patriarch heeft in Israël een crisis veroorzaakt door zijn toestemming te geven voor het verpachten van kerkelijk onroerend goed in Oost-Jeruzalem aan joodse investeerders. De transactie leidde tot woedende protesten van Palestijnse organisaties.

Vertegenwoordigers van de twaalf belangrijkste orthodoxe kerken stemden over de kwestie op een speciale synode. De synode heeft echter kerkrechtelijk geen zeggenschap over de patriarch en kan door Irineos worden genegeerd. Formeel kan Irineos alleen worden afgezet door de synode van Jeruzalem, die echter door hemzelf moet worden bijeengeroepen.