Balkenende werd ’s middags om half twee door vice–premier Zalm op de hoogte gesteld van het besluit van Nijs. Dat kwam tot stand na een gesprek dat ze had met de VVD–top. De premier heeft toen nog aan Zalm gevraagd of de beslissing van Nijs „definitief" was. Dat bleek het geval. Later heeft hij nog met Nijs zelf gesproken.

Balkenende zei in de Kamer het besluit van Nijs te betreuren. „Maandag hadden we nog geconstateerd dat er een basis was om door te gaan", aldus de premier. Hij wees erop dat het Tweede–Kamerdebat over Nijs weliswaar „pittig" was, maar dat er geen motie van wantrouwen tegen haar werd ingediend.

Volgens de minister was Nijs „geen staatssecretaris die disfunctioneert" en was er ook geen sprake van een onwerkbare situatie tussen Nijs en minister Van der Hoeven. „Maar ik heb het besluit van de staatssecretaris te respecteren", aldus Balkenende.

De premier nam afstand van kritiek van de PvdA dat hij „de regie kwijt zou zijn". Dat was volgens hem een „grijze plaat", omdat die kritiek in het verleden wel vaker over hem geuit was. „De bewindspersonen zitten er namens een partij en ik heb niet de regie in de VVD."