Abedini liet wel vaker zijn vrouw en twee kinderen achter in Amerika. Dan bezocht hij zijn geboorteland waar hij verschillende jaren een ondergrondse christelijke kerk leidde. De kerk groeide uit tot 100 huisgemeenten in 30 steden met 2000 leden. Ook zette hij een weeshuis op. Ook na zijn verhuizing naar Amerika in 2005 bleef het zijn doel om het Evangelie te verkondigen in Iran.

Tijdens zijn laatste bezoek aan Iran in juli, werd hij in de buurt van de Turks-Iraanse grens uit de bus getrokken. Hem werd gezegd dat hij gestraft moest worden voor zijn christelijke activiteiten van destijds. Hij werd onderworpen aan scherpe ondervragingen, zijn paspoort werd ingenomen en hij kreeg huisarrest. Sinds september zit hij opgesloten in de beruchte Evin-gevangenis, zo zei zijn vrouw Naghmeh in een interview aan Fox News. Zij en zijn Amerikaanse advocaten hopen met een mediacampagne Abedini vrij te krijgen.

Volgens zijn vrouw Naghmeh, werd Abedini op 20-jarige leeftijd bekeerd tot het christelijk geloof. Hij was een excellente leerling binnen de islam. Hij probeerde vroom te leven, maar hij hoe vromer hij leefde en hoe meer hij zich vastbeet in zijn opleiding, des te depressiever werd hij. Uiteindelijk werd hij opgeleid als zelfmoordterrorist binnen een radicale moslimgroep. Toen hij in contact kwam met het christendom, redde dat zijn leven.

Over de gezondheidssituatie van Abedini is nu niets bekend. Er zijn signalen dat hij geslagen wordt in de gevangenis. De Iraanse overheid heeft laten doorschemeren hem vrij te willen laten na het betalen van een borgsom. Later werd dat bericht weer ontkend.

Het Amerikaans Centrum voor Recht en Rechtvaardigheid (ACLJ) maakt zich als lobbyorganisatie in de Verenigde Staten sterk voor de vrijlating van Abedini.