De redactie van NU.nl laat weten achter Verhagen te staan en zeer verbolgen te zijn over het besluit. Volgens een vertegenwoordiger speelt er al een tijdje een conflict tussen de redactie en Verhagen enerzijds en het management van de uitgever anderzijds. Dat zou gaan over de journalistieke onafhankelijkheid.

Sanoma Media herkent zich echter absoluut niet in dit geschetste conflict, aldus een woordvoerster. Volgens haar is het „pertinent onwaar” dat de journalistieke onafhankelijkheid niet gewaarborgd is. Die onafhankelijkheid is namelijk waarom de site zoveel bezoekers trekt en om daar aan te tornen, zou „helemaal niet slim” zijn.

De zegsvrouw liet weten dat Sanoma en Verhagen samen hebben besloten om uit elkaar te gaan omdat ze een andere visie hebben op de toekomst. Verhagen wilde vrijdag zelf niet ingaan op zijn vertrek. Hij heeft met Sanoma afgesproken dat deze de woordvoering over zijn vertrek doet.

Verhagen was hoofdredacteur van NU.nl sinds april 2006. Vanaf maandag is Tonie Broekhuijsen interim-hoofdredacteur van de nieuwssite. Hij werkt al sinds 1984 bij Sanoma Media, onder meer voor de vrouwenbladen Libelle en Margriet en voor AutoWeek. Sinds 1 januari van dit jaar is Broekhuijsen Creative Director Digital Content bij Sanoma, een functie die hij zal combineren met de functie van ad-interim hoofdredacteur van NU.nl.

NU.nl is met ruim 5,4 miljoen bezoekers per maand de grootste nieuwssite van Nederland.