Bär zei niet te weten waarom hem is verboden zich over welk onderwerp ook uit te laten. Het was hem door „hoge instanties” in de Rooms-Katholieke Kerk opgelegd. Hij zal zich aan het verbod houden. „Ik heb me nooit verzet tegen kerkelijke wetten.” Hoewel er geen termijn is genoemd, neemt Bär (75) aan dat het spreek- en publicatieverbod voor de rest van zijn leven geldt.

Vanuit een pastorale invalshoek heeft Bär, ook toen hij nog bisschop was, inzake ethische kwesties en het verplichte priestercelibaat soms standpunten ingenomen die niet met die van het Vaticaan spoorden. Bär pleitte bij herhaling voor opheffing van het celibaat. Hij noemde het „ronduit slecht” dat hierover in de Rooms-Katholieke Kerk geen discussie mogelijk was. Ook pleitte hij voor verruiming van de regels voor deelname van niet-katholieken aan de eucharistie. De ophef rond de huwelijksdienst van prins Maurits en Marilène van den Broek noopt de kerken tot een gewetensonderzoek, zei hij in een RKK/KRO-uitzending.

Zelf leidde Bär in september 2001 in Auch (Frankrijk) de kerkdienst waarin het huwelijk van prinses Margarita en Edwin de Roy van Zuydewijn werd ingezegend.