De Chileense politie pakte hem op rond het middaguur (lokale tijd) toen hij in een taxi onderweg was naar de kustplaats Via Del Mar in het midden van Chili. Hij heeft zich niet verzet tijdens de arrestatie. Op de nieuwszender CNN is duidelijk te zien hoe Van der Sloot tussen politiemensen een gebouw wordt binnengebracht in de Chileense hoofdstad Santiago.

Hij bevindt zich volgens Peruaanse media in de vreemdelingenafdeling van de Chileense onderzoekspolitie in de hoofdstedelijke gemeente Independencia.

Van der Sloot zou de 21-jarige Peruaanse met geweld hebben omgebracht in een hotel in de wijk Miraflores in de Peruaanse hoofdstad Lima. Ze werd dood gevonden in een hotelkamer die op naam van Van der Sloot stond. Hij zou na de moord de grens met Chili over zijn gevlucht. Van der sloot wordt ook nog altijd verdacht van betrokkenheid bij de verdwijning van de Amerikaanse tiener Natalee Holloway in 2005.

De Chileense autoriteiten kunnen Joran van der Sloot formeel pas in voorarrest plaatsen als ze het internationale arrestatiebevel binnen hebben. Dat heeft het hoofd van de onderzoekspolitie van de Noord-Chileense grensstad Arica donderdag gezegd.

Het lokale hoofd van de politie, Nelson Oyarz£n, legt uit wat er nu met Joran van de Sloot gaat gebeuren. Hij laat weten dat zijn gegevens in de hoofdstad Santiago worden genoteerd en zijn identiteit wordt geverifieerd. „We kunnen alleen zijn identiteitspapieren innemen en een schriftelijke verklaring afnemen”, aldus Oyarz£n. Vervolgens wordt de Nederlander onder een soort huisarrest geplaatst, zodat hij niet kan ontsnappen.

De autoriteiten dachten dat Joran van de Sloot zich in Arica ophield, maar ze arresteerden hem op de snelweg tussen de hoofdstad Santiagio en de kustplaats Vi¤a del Mar. Hij bevond zich toen ter hoogte van het plaatsje Curacav¡, ongeveer 35 kilometer ten westen van de hoofdstad.

De vader van Stephany Flores, een zakenman, zei in een reactie op de aanhouding: „Ik hoop dat mijn dochter gelukkig is nu ze weet dat deze moordenaar gaat betalen voor wat hij heeft gedaan.” Eerder had hij op de Peruaanse televisie verklaard dat Van der Sloot in de nacht van zaterdag op zondag een casino had verlaten met zijn dochter.

De zaak-Holloway was op 30 mei precies vijf jaar oud. Natalee verdween na een avond stappen op Aruba. Ze zou met Van der Sloot zijn meegegaan, waarna ze verdween.

Hoe Stephany precies is gedood, is niet duidelijk. Volgens sommige Peruaanse media is ze doodgestoken; de krant El Comercio meldt op basis van de politie dat ze door klappen op haar hoofd en lichaam is omgekomen.