Van Ly werd in 2007 tot acht jaar gevangenisstraf veroordeeld wegens „propaganda tegen het communistische regime.” De Vietnamese rooms-katholieke dissident zat drie jaar in de gevangenis. Van Ly kampte de achterliggende maanden met ernstige gezondheidsproblemen. Er was vanuit het buitenland veel kritiek op zijn arrestatie.In februari 2007 viel de Vietnamese politie bij Nguyen Van Ly binnen en nam computers, telefoons en meer dan 200 kilo documenten in beslag. Zo probeerde de Vietnamese overheid de lancering van de democratische oppositiepartij Lac Hong te dwarsbomen.

Eind vorig jaar werd hij door het Europese parlement wegens zijn strijd voor de mensenrechten voorgedragen als kandidaat voor de Sacharovprijs.