Door de aanslagen kwamen negen mensen, onder wie de daders en twee Nederlanders, om het leven. Een van de terroristen zegt in de video: „Dit is geen zelfmoord, maar een goede daad". Een andere man zegt zonder in beeld te zijn: „Amerika, verwoest; Australië, verwoest; Indonesië, verwoest".Volgens de politie is duidelijk te zien hoe ontspannen de aanslagen zijn voorbereid. Andere filmpjes tonen hoe de terroristen inkopen doen en praten over de aanstaande aanslagen. Ook zijn op de laptop brieven gevonden waarin de werkwijze van de terreurcel omschreven staat.

Half september werd de meest gezochte terrorist van Zuidoost–Azië, de Maleisiër Noordin Mohammad Top, gedood. Hij wordt onder meer verantwoordelijk gehouden voor de zelfmoordaanslagen op de hotels in Jakarta. Ook zou Top achter de aanslag op twee discotheken op het vakantie–eiland Bali zitten. Daardoor vielen in oktober 2002 meer dan tweehonderd doden, onder wie vier Nederlanders.