Een voorstel daartoe kwam van het deputaatschap zelf. De voorzitter van het deputaatschap, ds. M. J. van Gelder (Middelburg): „We stellen voor het schip van het deputaatschap zo gauw mogelijk aan de wal te leggen.”Het deputaatschap heeft al jarenlang financiële zorgen. De inkomsten houden geen gelijke tred met de uitgaven. Door een teruglopend aantal kinderen op de internaten is het subsidiebedrag verminderd. Eventuele exploitatietekorten na 2007 kunnen niet meer uit het reservefonds worden opgevangen.

Het deputaatschap stelde de synode de vraag of de huidige bestuursstructuur nog de aangewezen vorm is om een schippersinternaat te exploiteren. Daarop besloot de synode het deputaatschap op te heffen. Het internaat gaat op termijn vermoedelijk fuseren.

Het deputaatschap emerituskas maakte melding van gesprekken met De Nederlandse Bank. Inzet daarvan was de vraag van de overheid of de emerituskas als gevolg van de nieuwe pensioenwet onder het toezicht van De Nederlandse Bank moet gaan vallen. Vastgesteld werd dat dit verstrekkende consequenties zou hebben, onder meer voor het aan te houden vermogen. Ook zouden er eisen worden gesteld aan bijvoorbeeld de invulling van de deputaatschappen.

De synode gaf het deputaatschap mandaat om de ontwikkelingen op dit punt en het overleg met het ministerie hierover te vervolgen. Zowel de synode als het deputaatschap sprak uit de zorg voor emeritaat als een eigen kerkelijke verantwoordelijkheid te willen blijven zien.