De twee inspectiediensten hebben de Europese Commissie over de matige veiligheid van het bedrijf ingelicht. FlyAir verzorgt voornamelijk vluchten tussen Turkije en Nederland en België. De IVW stelt onder andere dat het bedrijf de regels over bijtanken en het gelijktijdig laten instappen van passagiers niet goed uitvoert.Verder vliegt FlyAir buiten de tijden die het van de luchthavens krijgt toegewezen. In België komt de maatschappij vooral administratieve verplichtingen niet na.

Door het verscherpte toezicht kunnen toestellen van FlyAir ook op andere luchthavens in Europa aan extra controles worden onderworpen. Volgens een woordvoerder van de IVW zit „de bedrijfsvoering op het gebied van veiligheid van FlyAir tegen de zes min aan".

De zegsman stelt dat er op dit moment twee maatschappijen in Europa onder verscherpt toezicht staan. Naast FlyAir is dat het eveneens Turkse MNG Airlines. Met hun landgenoot Onur Air, die vorig jaar zelfs een vliegverbod opgelegd kreeg, is alles in orde, aldus de IVW.