De Indiase media citeerden overheidsfunctionarissen die de islamitische afscheidingsbewegingen in Kashmir ervan beschuldigden achter de aanslagen te zitten.„Wij veroordelen de treinexplosies in Mumbai en ontkennen elke betrokkenheid", aldus een woordvoerder van Lashkar. „Onze jihad is alleen tegen de Indiase troepen in Kashmir gericht. De islam staat het doden van onschuldige mensen niet toe".

Een politiechef zei dat de aanslag wel degelijk de vingerafdrukken van de separatistische beweging lijkt te hebben. Maar hij voegde eraan toe het officiële deskundigenrapport af te wachten. Waarschijnlijk is de kneedbomspringstof RDX gebruikt. Deze stof werd in het verleden gebruikt door Lashkar–e–Taiba. Ook de verboden Indiase Islamitische Studentenbeweging (SIMI) geldt als verdacht. De politie heeft op verschillende plaatsen huiszoeking gedaan, maar geen arresties verricht.

Zeker 183 lijken zijn inmiddels geborgen. Het persbureau PTI berichtte eerder dat zeker 190 mensen de dood hebben gevonden.