Eisenbach ontkent de aantijgingen en zijn besluit om af te treden is geen erkenning van schuld, zei een woordvoerder van het bisdom Mainz. Volgens hem heeft de hulpbisschop besloten zijn ambt neer te leggen vanwege het „negatieve effect van de publiciteit.” Eisenbach zal ander werk gaan verrichten in het bisdom. De plaatselijke politie en onderzoekers van het Vaticaan hebben volgens de zegsman besloten de zaak niet verder te onderzoeken.

De protestantse hoogleraar Änne Bäumer-Schleinkofer had de hulpbisschop in september 2000 bij justitie in Mainz aangeklaagd wegens seksueel misbruik en het toebrengen van lichamelijk letsel. Ook beschuldigde zij Eisenbach bij het Vaticaan ervan dat hij jarenlang het verplichte celibaat en het biechtgeheim heeft geschonden. Bovendien zou de hulpbisschop zich bij de vrouw op een ontoelaatbare manier hebben beziggehouden met exorcisme, waarbij kwade geesten worden uitgedreven.

Paus Johannes Paulus II heeft de ontslagaanvraag van Eisenbach aanvaard.