Het verzilten is een manier om blauwalg in het gebied tegen te gaan. De giftige blauwalg heeft vergaande consequenties voor de ecologie in het gebied. Ook treft het recreanten omdat de algengroei schadelijk is voor de gezondheid van zwemmers.

De landbouwsector is fel tegen het verzilten. Landbouwer J. L. C. Mol, die ook dagelijks bestuurder is bij het waterschap Zeeuwse Eilanden, zegt dat verzilting vooral in droge periodes problemen kan opleveren voor de landbouw. „Voor de beregening hebben we zoet water nodig. De verzilting van het Volkerak-Zoommeer zorgt ervoor dat we bepaalde groenten niet kunnen telen.”

Overigens wordt er niet veel gebruikgemaakt van het water uit het Volkerak-Zoommeer. „Maar ik weet van boeren die het water er wel met tanks vandaan halen en over hun land spuiten. Op het land zijn nog nooit schadelijke stoffen gevonden die het gevolg zijn van blauwalg.”

De Zeeuwse Milieufederatie (ZMF) is voorstander van de verzilting. Volgens G. van Zonneveld van de ZMF weegt de landbouw niet op tegen het belang van de ecologie in het gebied.

Het zogenaamde doorspoelen van het meer, een alternatief voor verzilting, ziet hij niet zitten. Het doorspoelen houdt in dat er in de winter vanuit rivieren zoet water in het meer wordt gelaten, zodat de kans op de aangroei van blauwalgen in de zomer kleiner wordt. Van Zonneveld: „Dat is niet haalbaar omdat er veel te weinig water voor beschikbaar is.”