Nederland doet sinds het begin (december 2008) mee aan Atalanta. Tussen augustus en eind dit jaar dient het Nederlands fregat Zr. Ms. Tromp als commandoschip.

Omdat de dreiging van piraterij voor de kust van de Hoorn van Afrika steeds kleiner wordt, wordt de omvang van de missie afgebouwd. Bij de taken horen ook het escorteren van schepen, waaronder voedselschepen van de VN en het in de gaten houden van vissers.

De afgelopen jaren wordt meer aandacht geschonken aan het Somalische vasteland, omdat daar de oorzaak ligt van de piraterij. Nederland doet met maximaal vijftien militairen mee aan een trainingsprogramma voor het Somalische leger.