De Spaanse onderzoeksrechter Garzon besloot in 2002 de partij voor drie jaar te verbieden. Hij baseerde zijn besluit op een omstreden wet tegen terroristische netwerken. De beslissing van het hooggerechtshof betekende een definitief verbod. Het beroep van Batasuna daartegen is door de hoogste rechters van het Constitutioneel Hof unaniem verworpen.

De advocaat die Batasuna vertegenwoordigt, noemde de uitspraak in strijd met de Spaanse grondwet en een schending van de mensenrechten. De advocaat heeft laten weten dat hij het vonnis gaat aanvechten bij het Europees Hof voor de Rechten van de Mens in Straatsburg.

Batasuna is de eerste politieke partij die verboden wordt sinds het land terugkeerde naar democratie, na de dood van dictator Francisco Franco in 1975. De partij heeft altijd geweigerd het geweld van de ETA expliciet te veroordelen. Sinds 1968 kwamen bij aanslagen van de terreurgroep bijna 850 mensen om het leven.