Micropia is gehuisvest in de historische Ledenlokalen uit 1870 van de Amsterdamse dierentuin Artis. Bezoekers kunnen hier al vanaf jonge leeftijd kennismaken met de kleinste en meest succesvolle organismen. Ook wil het museum een verbindende schakel zijn tussen wetenschap en publiek.

Een micro-organisme of microbe is te klein om met het blote oog te zien. Bijvoorbeeld een bacterie, een van de kleinste microben, past meer dan een miljoen keer op de punt van een naald. Deze micro-organismen, waaronder ook schimmels, gisten, algen en virussen, maken het leven op aarde mogelijk.

Het beeld dat veel mensen hebben van de onzichtbare microwereld is volgens de initiatiefnemers vooral negatief. Micropia moet daar verandering in brengen. Het museum verzekert dat je na een bezoek nooit meer hetzelfde naar jezelf en de wereld zult kijken.